Servidor Pubchem MCP

¿Qué hace el Servidor “Pubchem” MCP?

El Servidor Pubchem MCP (Model Context Protocol) actúa como un puente entre asistentes de IA y la API de PubChem, permitiendo la extracción fluida de información química básica sobre fármacos. Al integrarse con este servidor, los sistemas de IA pueden recuperar automáticamente detalles moleculares, sinónimos, identificadores y metadatos relacionados de compuestos químicos directamente desde PubChem. Esta capacidad mejora los flujos de trabajo de desarrollo en áreas como descubrimiento de fármacos, bioinformática e informática química al automatizar la recuperación de datos, reducir búsquedas manuales y permitir interacciones avanzadas basadas en datos dentro de entornos impulsados por IA. El servidor está diseñado para una integración sencilla y puede ser utilizado en diversas plataformas y herramientas que soportan el estándar MCP.

Lista de Prompts

No se mencionan plantillas de prompts específicas en el repositorio.

Lista de Recursos

No se listan recursos explícitos en el repositorio.

Lista de Herramientas

No se detallan herramientas explícitas en el server.py del repositorio ni en la documentación visible.

Casos de uso de este Servidor MCP

• Recuperación Automatizada de Datos Químicos: Obtén al instante propiedades químicas, identificadores y datos estructurales de cualquier fármaco o compuesto, optimizando los procesos de investigación y desarrollo.
• Búsqueda de Información de Fármacos: Proporciona a usuarios finales o investigadores detalles completos sobre fármacos conocidos, incluyendo sinónimos, fórmula molecular y enlaces a entradas de PubChem.
• Integración en Flujos de Bioinformática: Permite que flujos de trabajo impulsados por IA enriquezcan su contexto de datos con información química autorizada para tareas como reposicionamiento de fármacos o análisis de interacciones.
• Soporte para Herramientas Educativas: Permite que plataformas educativas ofrezcan información química rica y en tiempo real para enseñanza y demostraciones.
• Aplicaciones impulsadas por API: Soporte back-end para aplicaciones web o móviles que requieren datos químicos actualizados sin gestión manual de la API.

Cómo configurarlo

Windsurf

1. Requisitos previos: Asegúrate de tener Python 3.10 y las dependencias (python-dotenv, requests, mcp, uvicorn) instaladas.
2. Clonar e Instalar:

   git clone https://github.com/sssjiang/pubchem_mcp_server.git
   cd pubchem_mcp_server
   pip install .
   

3. Editar la Configuración: Abre tu configuración de Windsurf y añade el servidor Pubchem MCP:

   {
     "mcpServers": {
       "pubchem": {
         "command": "uvx",
         "args": ["pubchem_mcp_server"]
       }
     }
   }
   

4. Guardar y Reiniciar: Guarda los cambios y reinicia Windsurf.
5. Verificar: Prueba consultando un fármaco conocido.

Claude

1. Requisitos previos: Instala Python 3.10 y los paquetes necesarios.
2. Clonar e Instalar:

   git clone https://github.com/sssjiang/pubchem_mcp_server.git
   cd pubchem_mcp_server
   pip install .
   

3. Configura Claude: Añade a tu servers_config.json de Claude Desktop:

   {
     "mcpServers": {
       "pubchem": {
         "command": "uvx",
         "args": ["pubchem_mcp_server"]
       }
     }
   }
   

4. Reinicia Claude.
5. Verificar: Consulta un fármaco para confirmar la configuración.

Cursor

1. Requisitos previos: Python 3.10 y dependencias instaladas.
2. Clonar e Instalar:

   git clone https://github.com/sssjiang/pubchem_mcp_server.git
   cd pubchem_mcp_server
   pip install .
   

3. Añadir Servidor MCP: Actualiza el archivo de configuración de Cursor:

   {
     "mcpServers": {
       "pubchem": {
         "command": "uvx",
         "args": ["pubchem_mcp_server"]
       }
     }
   }
   

4. Reinicia Cursor.
5. Probar: Busca un compuesto conocido.

Cline

1. Requisitos previos: Instala Python 3.10 y las dependencias.
2. Clonar e Instalar:

   git clone https://github.com/sssjiang/pubchem_mcp_server.git
   cd pubchem_mcp_server
   pip install .
   

3. Editar la Configuración: Añade lo siguiente a tu servers_config.json:

   {
     "mcpServers": {
       "pubchem": {
         "command": "uvx",
         "args": ["pubchem_mcp_server"]
       }
     }
   }
   

4. Reinicia Cline.
5. Verificar Configuración: Confirma ejecutando una consulta de ejemplo.

Seguridad de Claves API

No se requieren claves API para acceder a la API de PubChem en la configuración actual. Si fuera necesario, las variables de entorno pueden definirse así:

{
  "env": {
    "PUBCHEM_API_KEY": "tu_clave_api"
  },
  "inputs": {}
}

Cómo usar este MCP dentro de flujos

Uso del MCP en FlowHunt

Para integrar servidores MCP en tu flujo de trabajo de FlowHunt, comienza añadiendo el componente MCP a tu flujo y conectándolo a tu agente de IA:

Haz clic en el componente MCP para abrir el panel de configuración. En la sección de configuración del sistema MCP, inserta los detalles de tu servidor MCP usando este formato JSON:

{
  "pubchem": {
    "transport": "streamable_http",
    "url": "https://tuservidormcp.ejemplo/rutadelmcp/url"
  }
}

Una vez configurado, el agente de IA podrá utilizar este MCP como herramienta con acceso a todas sus funciones y capacidades. Recuerda cambiar “pubchem” por el nombre real de tu servidor MCP y reemplazar la URL por la de tu propio servidor MCP.

Resumen

Según lo anterior, el Servidor Pubchem MCP está muy enfocado en un dominio específico (información química/farmacológica), es fácil de instalar y se integra con clientes MCP, pero carece de documentación sobre prompts, recursos o funciones avanzadas como muestreo o raíces.

Nuestra opinión

Este servidor MCP es sencillo y funcional para su propósito, pero carece de funciones MCP más amplias y documentación que lo harían más versátil para usuarios avanzados. Calificación: 3/10.

Puntuación MCP